Polipektomija je zahvat kojim se pomoću električnog noža (elektrokauter) odstranjuju izrasline (polipi) iz probavne cijevi, a koje se mogu naći cijelom dužinom probavne cijevi, to jest od nivoa jednjaka do završnog dijela debelog crijeva, ali najčešće polipi se pojavljuju u debelom crijevu. Proces je u potpunosti bezbolan i preporuča ga se ukoliko je moguće učiniti odmah nakon, odnosnu u sklopu, gornje (gastrosopija) ili donje (kolonoskopija) endoskopije, kako bi se izbjegli dodatni financijski izdaci kao i ponovna priprema pacijenta.

Odstranjeni polip se obavezno šalje na patohistološku analizu kako bi se isključila zloćudna priroda izrasline, odnosno točno procijenila priroda procesa. Ovisno o pato-histološkom nalazu slijedi daljna dijagnostička obrada i liječenje ako je potrebno, a sami pato-histološki nalaz ima značajan utjecaj na određivanje ritma kontrolnih pregleda. Iznimno rijetko nakon odstranjenja polipa može doći do krvarenja koje se u pravilu jednostavno zaustavlja.